El informe GEM Madrid Comunidad comienza en el año 2003, con la participación de investigadores de la Universidad Autónoma de Madrid y con el apoyo de la Comunidad de Madrid hasta el año 2010. Desde ese año se han elaborado anuales del municipio de Madrid, hasta el año 2016, con el patrocinio del órgano competente en materia de emprendimiento del Ayuntamiento de Madrid.

En el año 2018 se reanudó la Colaboración con la Comunidad de Madrid, mediante  la elaboración de un nuevo informe GEM Madrid que incluyó una estratificación de la muestra por zonas con un perfil socioeconómico homogéneo con la finalidad de extraer conclusiones mas específicas cara a la formulación de políticas regionales.

Actualmente este equipo está liderado por el profesor Isidro de Pablo y las principales líneas de investigación que desarrollan se relacionan con el impacto de la iniciativa emprendedora en el desarrollo del territorio, el emprendimiento corporativo, y, más recientemente, en el análisis comparativo de ecosistemas para el emprendimiento de alto valor añadido.